A modulação do sistema nervoso autônomo (SNA) pela acupuntura providencia uma rota mecanística que produz respostas terapêuticas tais como controle da inflamação, alívio da dor e saúde cardiovascular. Com o objetivo de avaliar a correlação cerebral do SNA em resposta a acupuntura em diferentes acupontos. Para avaliar a resposta do SNA a acupuntura, um trabalho foi realizado aplicando ressonância magnética funcional relacionada a eventos (er-fMRI) em conjunto com registros do SNA (frequência cardíaca e resposta de condutância da pele). Acupuntura manual foi aplicada nos acupontos Zusanli (E36) e Yinlingquan (Ba9), enquanto um estímulo foi aplicado em uma localização controle chamada de SH1. A acupuntura produziu uma ativação no córtex motor, ínsula, córtex cingulado e desativação da rede em modo padrão. Diferenças entre os acupontos foram encontradas na ativação da ínsula anterior, na qual foi maior em Yinlingquan (Ba9) comparado com Zusanli (E36), enquanto Zusanli (E36) apresenta uma desativação mais abrangente na rede em modo padrão que Yinlingquan (Ba9) e SH1.
A redução da frequencia cardíaca e da impedância da pele foi observado tanto na acupuntura real (Zusanli e Yinlingquan) como falsa (SH1). Acupuntura com forte resposta de condutância da pele, também produziu maior ativação da ínsula anterior. A desativação da rede em modo padrão se relacionou com a redução da frequência cardíaca. Diferentes respostas cerebrais sustentam que o estímulo da acupuntura em diferentes acupontos pode estar relacionado a diferentes fluxos autonômicos, que são responsáveis pelo efeitos terapêuticos do método.